在大型灾害发生的时候，日本首相将设置“非常灾害对策本部”，并亲自领衔调度指挥。2003年，日本宫城县东部发生7级地震，这一次地震救援的参与者向世界展现了“惊人”的一幕：震后6分钟，首相官邸危机管理中心迅速成立对策室召开各部门紧急会议，指挥国土交通省、海上保安厅、总务省等部门开展工作；10多分钟后，宫城县警察总部直升机开始向首相官邸传送灾区图像；1个多小时后，内阁防灾大臣召开新闻发布会公布政府救灾措施。

经历过1995年阪神大地震的重创后，日本政府开始不定期发布基于科研成果的“地震报告”。这些报告由“中央防灾会议”根据地震专家最新研究成果制定，绘出7级地震发生后，甚至还勾勒出地震可能造成的具体死伤受灾情况、标明可能发生的海啸最先淹没的地区，和火灾最容易发生的地区。近几年，日本政府曾不断提醒日本国民，在以东京为中心的首都圈内，随时可能发生里氏7级地震。

负责向民众公布预测报告的机构，是政府下设的最高决策机构——“中央防灾会议”。这一机构的主席由日本首相亲自担任，成员由防灾担当大臣、内阁各部长、四家指定公共机构——包括日本电讯电话公司（NTT）、日本广播协会（NHK）、日本银行、日本红十字会的负责人以及四名科学领域权威学者组成，专门负责制定全国防灾基本计划和审议有关防灾的重要事项，其下设的“专门调查会”负责为会议出台报告提供各种资料。

在日本，公立中小学今儿公园是常设的应急避难场所，与日本大多数城市的平均人口密度比起来，用“星罗棋布”加以形容并不为过。位于日本近畿地区中部的明石市，面积仅50平方公里、人口不到30万人，却有约42个应急避难所和10个防灾公园。市内的每个应急避难所都由3名志愿者负责日常管理，在10个防灾公园内都专门设置储备仓库和可供1万人3天的饮用水的耐震型储水槽，仓库内储备的专用防灾食品保质期长达5年。